Hahn đã tham gia Linkin Park khi ban nhạc được gọi là Xero năm 1996 với vai trò người đẩy đĩa. Kể từ đó, anh đã đạo diễn video nhạc cho hầu hết đĩa đơn của band, ngoại trừ "One Step Closer", "Crawling" và "Faint". Anh tự gọi mình là Mr. Hahn ở đoạn đầu của bài "Cure for the Itch" từ album "Hybrid Theory".

Trong album mới Minutes to Midnight, Joe Hahn đóng góp nhiều hơn trong việc lập trình với bảng hiệu ứng âm thanh của anh và dùng bảng MIDI nhiều hơn. Những bài hát anh dùng bàn quay đĩa trong Minutes to Midnight với vai trò rất nhỏ là "What I've Done", "Valentine's Day", và "In Pieces".

Joe cũng dùng bàn MIDI trong một vài bài của Linkin Park như "In The End", "Crawling" và "Numb".